MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 58853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	AAT	2	6	936	941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
2	NC_021827	CGAT	2	8	987	994	25 %	25 %	25 %	25 %	525896798
3	NC_021827	CCA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896798
4	NC_021827	CGG	2	6	1016	1021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896798
5	NC_021827	TCA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896798
6	NC_021827	CT	3	6	1115	1120	0 %	50 %	0 %	50 %	525896798
7	NC_021827	ATAA	2	8	1176	1183	75 %	25 %	0 %	0 %	525896798
8	NC_021827	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
9	NC_021827	TTC	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
10	NC_021827	GGTT	2	8	1265	1272	0 %	50 %	50 %	0 %	525896798
11	NC_021827	TCT	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
12	NC_021827	A	6	6	1301	1306	100 %	0 %	0 %	0 %	525896798
13	NC_021827	T	6	6	1358	1363	0 %	100 %	0 %	0 %	525896798
14	NC_021827	CTT	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
15	NC_021827	TGT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896798
16	NC_021827	TGC	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896798
17	NC_021827	ATCC	2	8	1667	1674	25 %	25 %	0 %	50 %	525896798
18	NC_021827	TAA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
19	NC_021827	GCA	3	9	1767	1775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896798
20	NC_021827	CCA	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896798
21	NC_021827	TTC	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
22	NC_021827	GTT	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896798
23	NC_021827	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
24	NC_021827	TG	3	6	2163	2168	0 %	50 %	50 %	0 %	525896798
25	NC_021827	ATA	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
26	NC_021827	AGC	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896798
27	NC_021827	TTC	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
28	NC_021827	TTC	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
29	NC_021827	TTC	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
30	NC_021827	CTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
31	NC_021827	GACG	2	8	2359	2366	25 %	0 %	50 %	25 %	525896798
32	NC_021827	TTC	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
33	NC_021827	TTC	2	6	2546	2551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
34	NC_021827	GAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896799
35	NC_021827	AGC	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
36	NC_021827	CG	3	6	2624	2629	0 %	0 %	50 %	50 %	525896799
37	NC_021827	ATA	2	6	2654	2659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896799
38	NC_021827	T	6	6	2746	2751	0 %	100 %	0 %	0 %	525896799
39	NC_021827	TGGTTC	2	12	2756	2767	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525896799
40	NC_021827	GAA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896799
41	NC_021827	ATC	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896799
42	NC_021827	TCT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
43	NC_021827	CAG	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
44	NC_021827	TTC	2	6	3071	3076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
45	NC_021827	CCAA	2	8	3080	3087	50 %	0 %	0 %	50 %	525896799
46	NC_021827	CAG	2	6	3130	3135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
47	NC_021827	AAT	2	6	3230	3235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896799
48	NC_021827	TTTC	2	8	3283	3290	0 %	75 %	0 %	25 %	525896799
49	NC_021827	CAC	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896799
50	NC_021827	TTTTTC	2	12	3320	3331	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896799
51	NC_021827	AT	3	6	3336	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	525896799
52	NC_021827	ACT	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896799
53	NC_021827	T	6	6	3609	3614	0 %	100 %	0 %	0 %	525896800
54	NC_021827	TTC	2	6	3632	3637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896800
55	NC_021827	T	6	6	3667	3672	0 %	100 %	0 %	0 %	525896800
56	NC_021827	CAT	3	9	3763	3771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896800
57	NC_021827	ATA	2	6	3772	3777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896800
58	NC_021827	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896800
59	NC_021827	TAATTT	2	12	3970	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896800
60	NC_021827	AGC	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896800
61	NC_021827	CTT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
62	NC_021827	GGA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896801
63	NC_021827	TAA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896801
64	NC_021827	CTT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
65	NC_021827	T	6	6	4205	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	525896801
66	NC_021827	TTCC	2	8	4241	4248	0 %	50 %	0 %	50 %	525896801
67	NC_021827	GTC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896801
68	NC_021827	T	6	6	4320	4325	0 %	100 %	0 %	0 %	525896801
69	NC_021827	TTC	2	6	4377	4382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
70	NC_021827	TAAA	2	8	4422	4429	75 %	25 %	0 %	0 %	525896801
71	NC_021827	GC	3	6	4507	4512	0 %	0 %	50 %	50 %	525896802
72	NC_021827	TTCC	2	8	4584	4591	0 %	50 %	0 %	50 %	525896802
73	NC_021827	AGT	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896802
74	NC_021827	TCA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896802
75	NC_021827	CGT	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896802
76	NC_021827	AAT	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
77	NC_021827	TAA	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
78	NC_021827	TCTT	2	8	4808	4815	0 %	75 %	0 %	25 %	525896802
79	NC_021827	CAAA	2	8	4864	4871	75 %	0 %	0 %	25 %	525896802
80	NC_021827	T	6	6	4915	4920	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
81	NC_021827	AT	3	6	5007	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
82	NC_021827	AAT	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
83	NC_021827	TTC	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
84	NC_021827	CCA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896802
85	NC_021827	AAT	2	6	5119	5124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
86	NC_021827	TGC	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896802
87	NC_021827	TCT	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
88	NC_021827	CTT	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
89	NC_021827	AT	3	6	5180	5185	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
90	NC_021827	CTT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
91	NC_021827	TAT	2	6	5293	5298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896802
92	NC_021827	A	7	7	5325	5331	100 %	0 %	0 %	0 %	525896802
93	NC_021827	G	6	6	5397	5402	0 %	0 %	100 %	0 %	525896802
94	NC_021827	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896802
95	NC_021827	TTG	2	6	5424	5429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896802
96	NC_021827	TA	3	6	5442	5447	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
97	NC_021827	TGG	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896802
98	NC_021827	T	8	8	5507	5514	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
99	NC_021827	T	7	7	5520	5526	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
100	NC_021827	A	6	6	5532	5537	100 %	0 %	0 %	0 %	525896802
101	NC_021827	G	6	6	5604	5609	0 %	0 %	100 %	0 %	525896802
102	NC_021827	AGA	2	6	5610	5615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896802
103	NC_021827	TTG	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896802
104	NC_021827	TA	3	6	5649	5654	50 %	50 %	0 %	0 %	525896802
105	NC_021827	TGG	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896802
106	NC_021827	T	7	7	5715	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
107	NC_021827	T	7	7	5727	5733	0 %	100 %	0 %	0 %	525896802
108	NC_021827	ATT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896803
109	NC_021827	T	6	6	6240	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	525896803
110	NC_021827	GCT	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896803
111	NC_021827	GAA	2	6	6298	6303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896803
112	NC_021827	CTA	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896803
113	NC_021827	CTT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896803
114	NC_021827	T	6	6	6324	6329	0 %	100 %	0 %	0 %	525896803
115	NC_021827	ACC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896803
116	NC_021827	TTC	2	6	6480	6485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896803
117	NC_021827	GTT	2	6	6628	6633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896803
118	NC_021827	TTG	2	6	6669	6674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896803
119	NC_021827	TGC	3	9	6843	6851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896803
120	NC_021827	ATC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896803
121	NC_021827	ATT	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896803
122	NC_021827	TTTA	2	8	7212	7219	25 %	75 %	0 %	0 %	525896804
123	NC_021827	CTT	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
124	NC_021827	TTC	3	9	7243	7251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
125	NC_021827	TTCTGC	2	12	7285	7296	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525896804
126	NC_021827	TCT	2	6	7328	7333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
127	NC_021827	ATT	2	6	7346	7351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896804
128	NC_021827	T	6	6	7401	7406	0 %	100 %	0 %	0 %	525896804
129	NC_021827	CGC	2	6	7428	7433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896804
130	NC_021827	T	7	7	7511	7517	0 %	100 %	0 %	0 %	525896804
131	NC_021827	TCA	2	6	7523	7528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896804
132	NC_021827	GCT	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896804
133	NC_021827	ATC	2	6	7591	7596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896804
134	NC_021827	GGA	2	6	7624	7629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896804
135	NC_021827	CGC	2	6	7764	7769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896804
136	NC_021827	T	6	6	7911	7916	0 %	100 %	0 %	0 %	525896804
137	NC_021827	TCT	2	6	7919	7924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
138	NC_021827	GCG	2	6	7973	7978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896804
139	NC_021827	TCT	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
140	NC_021827	CTT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
141	NC_021827	GTT	2	6	8030	8035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896804
142	NC_021827	CTG	2	6	8037	8042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896804
143	NC_021827	GCCAT	2	10	8054	8063	20 %	20 %	20 %	40 %	525896804
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145	NC_021827	GTTT	2	8	8130	8137	0 %	75 %	25 %	0 %	525896805
146	NC_021827	TA	3	6	8142	8147	50 %	50 %	0 %	0 %	525896805
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150	NC_021827	ACT	3	9	8240	8248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896805
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152	NC_021827	CGA	2	6	8301	8306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896805
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154	NC_021827	AGC	2	6	8395	8400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896805
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158	NC_021827	ATA	2	6	8708	8713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896805
159	NC_021827	A	7	7	8751	8757	100 %	0 %	0 %	0 %	525896805
160	NC_021827	TGT	2	6	8803	8808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896805
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162	NC_021827	ACAGT	2	10	8852	8861	40 %	20 %	20 %	20 %	525896805
163	NC_021827	T	6	6	9017	9022	0 %	100 %	0 %	0 %	525896806
164	NC_021827	CTT	2	6	9067	9072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
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166	NC_021827	TTC	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
167	NC_021827	T	6	6	9097	9102	0 %	100 %	0 %	0 %	525896806
168	NC_021827	CTT	3	9	9103	9111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
169	NC_021827	CTT	2	6	9118	9123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
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261	NC_021827	CAT	2	6	13713	13718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896807
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265	NC_021827	CTT	2	6	14135	14140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896808
266	NC_021827	ATC	2	6	14158	14163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896808
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268	NC_021827	CTTTT	2	10	14245	14254	0 %	80 %	0 %	20 %	525896808
269	NC_021827	T	6	6	14251	14256	0 %	100 %	0 %	0 %	525896808
270	NC_021827	TAA	2	6	14296	14301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896808
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